Fen-Edebiyat Fakültesi, İstanbul Aydın Üniversitesi'nin, İktisadi İdari Bilimler ve Mühendislik-Mimarlık Fakülteleri ile birlikte ilk kurulan fakültelerinden biridir. Kurucu dekanlık görevini 03.09.2007 tarihinden 30.06.2011'e kadar sürdüren Prof. Dr. Yahya Kemal Yoğurtçu'nun ardından bu görev 02.07.2011-26.08.2011 tarihleri arasında dekan yardımcısı Prof. Dr. İsmail Tok tarafından vekâleten, 2011- 2018 tarihleri arasında Prof. Dr. Şuayip Karakaş tarafından yürütülmüştür. 2018-2022 tarihleri arasında Prof. Dr. Nükhet Çıkrıkçı tarafından yürütülmüştür. Prof. Dr. Tarık OĞUZLU 31.01.2022-31.01.2026, Prof. Dr. Ragıp Kutay Karaca 02.02.2026-29.03.2026, Prof. Dr. Nevzat Hafis YANIK 30.03.2026-Halen.
